30 мая 2012 года аэропорт Горно-Алтайска принял первый регулярный рейс из Москвы. Самолет Аэробус А-320 авиакомпании "Сибирь" совершил посадку в аэропорту столицы Республики Алтай в 5:56 (2:56 мск), время полета составило ровно четыре часа.
В торжественном мероприятии, посвященному началу регулярного авиасообщения между Москвой и Горно-Алтайском, приняли участие Глава Республики Алтай Александр Бердников, Председатель государственного собрания региона Иван Белеков, Президент компании "Сибмост" (оператор аэропорта) Альберт Кошкин, Генеральный представитель авиакомпании "Сибирь" в Сибирском регионе Эдуард Пушненко, а также руководители федеральных органов власти в регионе, представители республиканских министерств, ведомств и общественности.
В тот же день для пассажиров и участников торжественного мероприятия состоялась презентация туристических объектов и предприятий республики.
Аэропорт Горно-Алтайск открыт после реконструкции в ноябре 2011г. В рамках реконструкции проведено удлинение взлетно-посадочной полосы до 2,3 км, строительство и модернизация объектов аэродромной инфраструктуры (перрон, места стоянок воздушных судов), построен новый командно-диспетчерский пункт, аварийно-спасательная станция, смонтировано и установлено современное оборудование, в том числе светосигнальное, навигационное, радиотехническое и метеорологическое. Здания аэропортового комплекса укомплектованы необходимым оборудованием, включая пожарную сигнализацию, отвечающим всем современным требованиям. Контрольная (охранная) зона аэропорта усилена дополнительными системами видеонаблюдения. В настоящий момент аэропорт способен принимать такие типы воздушных судов, как Ту-204; Boeing-737, -757, -767; Аirbus-319, -320 и другие классом ниже
В обновленном аэропорту созданы все условия для безопасной и комфортной работы воздушной гавани. Выполняются перевозки по маршруту Новосибирск – Горно-Алтайск – Новосибирск и Москва - Горно-Алтайск- Москва.